Сидоров Р.Ю., Ткаченко А.Г.
ВЛИЯНИЕ ЭКСПРЕССИИ ГЕНА REL ИЗ MYCOBACTERIUM SMEGMATIS НА АКТИВНОСТЬ RPOS-LACZ-СЛИЯНИЯ В ESCHERICHIA COLI ^{[№ 9 ' 2017]}
Гуанозинтетрафосфат (ppGpp) является важной регуляторной молекулой бактерий, вовлеченной в процессы стринджент-ответа, регуляции персистенции, адаптации к стрессу, патогенности. Белок Rel из Mycobacterium smegmatis ответственен за синтез и деградацию ppGpp. Исследование посвящено детекции внутриклеточного уровня гуанозинтетрафосфата при помощи генного слияния ppGpp-зависимого гена rpoS с репортерным lacZ применительно к штамму с экспрессионной плазмидой pMind::rel. Использованный метод оценки позволяет количественно определять низкие концентрации гуанозинтетрафосфата, что трудновыполнимо при использовании методов аналитической химии. На данный момент метод не разработан для микобактерий, поэтому возникает потребность в использовании подходов анализа микобактериальных ppGpp-синтетаз на кишечной палочке. В рамках исследования была сконструирована микобактериальная экспрессионная плазмида pMind с вставкой rel из Mycobacterium smegmatis. Полученная плазмида и исходный вектор были трансформированы в штамм со слиянием rpoS-lacZ. Культуры сравнивались путем измерения активности β-галактозидазы.
В штамме Escheriсhia coli, несущем плазмиду pMind с вставкой rel, было отмечено увеличение экспрессии rpoS по сравнению с контролем c плазмидой без вставки. Добавка индуктора экспрессии pMind тетрациклина не оказывала влияния на экспрессию rpoS.
Исходя из полученных данных, можно сделать вывод о наличии экспрессии с промотора tetA в экспрессионной плазмиде pMind и сохранении ферментативной активности белка Rel из Mycobacterium smegmatis в Escherichia coli. Отсутствие тетрациклиновой индукции может являться следствием неспособности репрессора TetR из pMind связываться с регуляторными участками в Escherichia coli.

Хаова Е.А., Кашеварова Н.М., Ткаченко А.Г.
РЕГУЛЯЦИЯ БАКТЕРИАЛЬНОЙ ПЕРСИСТЕНЦИИ ПОЛИАМИНАМИ ЧЕРЕЗ СТИМУЛЯЦИЮ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ RPOS, YQJD И RMF ^{[№ 9 ' 2017]}
Персисторы — это малочисленная субпопуляция клеток, которые, находясь в дормантном состоянии, характеризуются пониженной чувствительностью к воздействию различных стрессорных факторов, в т. ч. антибиотиков. После прекращения воздействия антибактериального препарата персисторы способны возобновлять рост. Благодаря этим особенностям персисторные клетки являются основной причиной рецидивов инфекционных заболеваний. В качестве факторов персистенции рассматривают компоненты общего стрессорного ответа, а также полиамины.
Изучена роль полиаминов путресцина, спермидина и кадаверина в регуляции персистенции Escherichia coli при периодическом культивировании. Регуляция осуществляется через стимуляцию экспрессии генов rpoS, yqjD и rmf, являющихся компонентами общего стрессорного ответа. На экспрессию гена rpoS наибольший стимулирующий эффект оказывает спермидин, а экспрессия гена yqjD находится в меньшей зависимости от полиаминов. Нами показан rpoS-зависимый характер экспрессии гена yqjD, что согласуется с ранее опубликованными данными. Вероятно, полиамины регулируют экспрессию гена yqjD через стимуляцию экспрессии гена rpoS. Согласно результатам исследования, мутанты с нокаутами изучаемых генов в целом демонстрируют более низкие значения частоты персистенции по сравнению с контролем. Наибольшее снижение частоты персистенции rpoS-нокаутного штамма по сравнению с родительским штаммом наблюдается в ранней стационарной фазе, а yqjD- и rmf-нокаутных штаммов — в поздней стационарной фазе. Эти выводы подтверждаются данными об уровне персистенции штаммов с множественными нокаутами.
Таким образом, ген rpoS, стимулируемый в большей степени спермидином, вносит максимальный вклад в регуляцию персистенции в ранней стационарной фазе. Ген rmf, также относящийся к полиаминовому модулону, и ген yqjD, экспрессия которого незначительно повышается полиаминами, участвуют в регуляции персистенции в поздней стационарной фазе.

Каныгина О.Н., Кравцова О.С., Анисина И.Н., Четверикова А.Г., Сальникова Е.В., Достова Т.М., Ткаченко А.А.
ДИСПЕРСИОННЫЙ АНАЛИЗ МОНТМОРИЛЛОНИТОСОДЕРЖАЩЕЙ ГЛИНЫ ОРЕНБУРЖЬЯ ^{[№ 12 ' 2011]}
Проведен дисперсионный анализ монтмориллонитосодержащей глины Оренбуржья, основанный на ситовом анализе, седиментации и оптической микроскопии. Установлено, что разделение исследуемой глины по двум фракциям целесообразно. Из мелкодисперсной фракции при оптимизации режимов синтеза возможно получение микропористой керамики высокой плотности и прочности.